Причинами снижения всхожести семян при хранении могут быть повышение их влажности, поражение болезнями и вредителями. Оптимальная температура для хранения семян 0-5°, влажность воздуха – ниже 55%. Самое важное условие их качественного хранения – сухость воздуха. Температура воздуха для большинства семян не имеет большого значения, важно только, чтобы не было резких колебаний температур от высоких к низким, что приводит к отпотеванию семян, повышению их влажности и порче. Низкие температуры отрицательно влияют на сухие семена только теплолюбивых культур, прежде всего бахчевых. Температура свыше 17° приводит к иссушению семян.
Лучшая тара для их хранения – полиэтиленове мешочки (завязанные или запаянные). Но при хранении семян в этой таре влажность их должна быть не больше (%) : у огурцов, перца, томатов – 5-6; брюквы, капусты, лука, моркови, пастернака, петрушки, редиса – 6; у бобов, гороха, фасоли – 7; у арбуза, тыквы, дыни, салата – 5.